MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Ruminococcus albus 7 plasmid pRUMAL03

Total Repeats: 111

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_014826	ACA	2	6	13	18	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
2	NC_014826	GCGG	2	8	23	30	0 %	0 %	75 %	25 %	Non-Coding
3	NC_014826	AGT	2	6	49	54	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
4	NC_014826	TAG	3	9	75	83	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
5	NC_014826	TG	3	6	105	110	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
6	NC_014826	AGT	2	6	121	126	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
7	NC_014826	AG	3	6	163	168	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
8	NC_014826	GATC	2	8	169	176	25 %	25 %	25 %	25 %	Non-Coding
9	NC_014826	TTGA	2	8	964	971	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
10	NC_014826	A	7	7	1005	1011	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_014826	T	7	7	1040	1046	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
12	NC_014826	TGT	2	6	1205	1210	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
13	NC_014826	TA	3	6	1216	1221	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_014826	TA	3	6	1237	1242	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
15	NC_014826	T	6	6	1858	1863	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
16	NC_014826	TAAA	2	8	1868	1875	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
17	NC_014826	AT	3	6	1907	1912	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
18	NC_014826	AG	3	6	1987	1992	50 %	0 %	50 %	0 %	Non-Coding
19	NC_014826	TAAA	2	8	2014	2021	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
20	NC_014826	A	6	6	2019	2024	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
21	NC_014826	AAT	2	6	2100	2105	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_014826	AT	3	6	2134	2139	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_014826	AT	6	12	2163	2174	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_014826	TG	3	6	2194	2199	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
25	NC_014826	TAT	2	6	2327	2332	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_014826	A	7	7	2376	2382	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_014826	TGA	2	6	2454	2459	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
28	NC_014826	TATT	2	8	2460	2467	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_014826	A	6	6	3473	3478	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
30	NC_014826	CCT	2	6	3481	3486	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
31	NC_014826	AACG	2	8	3515	3522	50 %	0 %	25 %	25 %	Non-Coding
32	NC_014826	CAT	2	6	3533	3538	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_014826	GTT	2	6	3608	3613	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
34	NC_014826	T	7	7	3671	3677	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
35	NC_014826	TAT	2	6	3683	3688	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
36	NC_014826	TAT	2	6	3708	3713	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
37	NC_014826	TTA	2	6	3718	3723	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_014826	ATTT	2	8	3785	3792	25 %	75 %	0 %	0 %	Non-Coding
39	NC_014826	TTA	2	6	3824	3829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_014826	A	8	8	3836	3843	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
41	NC_014826	CTTCC	2	10	3848	3857	0 %	40 %	0 %	60 %	Non-Coding
42	NC_014826	AT	3	6	3860	3865	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
43	NC_014826	T	6	6	3900	3905	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
44	NC_014826	A	6	6	4729	4734	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
45	NC_014826	T	6	6	4789	4794	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
46	NC_014826	AC	3	6	4812	4817	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
47	NC_014826	TCA	2	6	5235	5240	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
48	NC_014826	ATA	2	6	5242	5247	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
49	NC_014826	ATT	2	6	5262	5267	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
50	NC_014826	CG	3	6	5285	5290	0 %	0 %	50 %	50 %	Non-Coding
51	NC_014826	T	8	8	5322	5329	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
52	NC_014826	AT	3	6	5332	5337	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
53	NC_014826	TTC	2	6	5372	5377	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
54	NC_014826	TGT	2	6	5425	5430	0 %	66.67 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
55	NC_014826	TTGA	2	8	5507	5514	25 %	50 %	25 %	0 %	Non-Coding
56	NC_014826	CAC	2	6	5581	5586	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
57	NC_014826	A	7	7	5613	5619	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
58	NC_014826	ATA	2	6	5648	5653	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
59	NC_014826	TAA	2	6	5665	5670	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
60	NC_014826	AT	3	6	5781	5786	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
61	NC_014826	T	6	6	5826	5831	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
62	NC_014826	CCA	2	6	5855	5860	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
63	NC_014826	CCT	2	6	5886	5891	0 %	33.33 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
64	NC_014826	T	6	6	5891	5896	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
65	NC_014826	TTA	2	6	5904	5909	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
66	NC_014826	TTA	2	6	5927	5932	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
67	NC_014826	ATTA	2	8	5998	6005	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
68	NC_014826	T	7	7	6009	6015	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
69	NC_014826	TA	4	8	6033	6040	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
70	NC_014826	T	6	6	6041	6046	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
71	NC_014826	A	6	6	8086	8091	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
72	NC_014826	AATA	2	8	8096	8103	75 %	25 %	0 %	0 %	Non-Coding
73	NC_014826	TAC	2	6	8120	8125	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
74	NC_014826	CAT	2	6	8150	8155	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
75	NC_014826	TAG	2	6	8200	8205	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
76	NC_014826	TGG	2	6	8264	8269	0 %	33.33 %	66.67 %	0 %	Non-Coding
77	NC_014826	A	6	6	8964	8969	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
78	NC_014826	TA	3	6	8979	8984	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
79	NC_014826	GAA	2	6	8996	9001	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
80	NC_014826	TA	3	6	9031	9036	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
81	NC_014826	CAT	2	6	9107	9112	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
82	NC_014826	AGA	2	6	9114	9119	66.67 %	0 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
83	NC_014826	ATA	2	6	9168	9173	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
84	NC_014826	T	6	6	9255	9260	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
85	NC_014826	TAA	2	6	9305	9310	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
86	NC_014826	T	7	7	9350	9356	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
87	NC_014826	TAC	2	6	9464	9469	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
88	NC_014826	AGC	2	6	9485	9490	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
89	NC_014826	AT	3	6	9560	9565	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
90	NC_014826	T	6	6	9588	9593	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
91	NC_014826	A	6	6	9646	9651	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
92	NC_014826	A	6	6	9891	9896	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
93	NC_014826	AAAG	2	8	10156	10163	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
94	NC_014826	AT	3	6	10197	10202	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
95	NC_014826	ATGAC	2	10	10212	10221	40 %	20 %	20 %	20 %	Non-Coding
96	NC_014826	CTG	2	6	10277	10282	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
97	NC_014826	TAG	2	6	10295	10300	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
98	NC_014826	CTT	2	6	10335	10340	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
99	NC_014826	TA	3	6	10369	10374	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
100	NC_014826	AT	3	6	10375	10380	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
101	NC_014826	ATT	2	6	14689	14694	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
102	NC_014826	A	6	6	15426	15431	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
103	NC_014826	CAA	2	6	15595	15600	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
104	NC_014826	TGA	2	6	15604	15609	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
105	NC_014826	TC	3	6	15711	15716	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
106	NC_014826	AAAC	2	8	15726	15733	75 %	0 %	0 %	25 %	Non-Coding
107	NC_014826	TCT	2	6	15740	15745	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
108	NC_014826	A	6	6	15755	15760	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
109	NC_014826	TAT	2	6	15824	15829	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
110	NC_014826	GTA	2	6	15847	15852	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
111	NC_014826	CTT	2	6	15854	15859	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.